INSAR 2021. Grande analyse génétique de l'autisme et plus grand nombre de candidats

La liste s'allonge : La dernière itération de la plus grande étude génétique sur l'autisme révèle 255 gènes ayant un lien avec l'autisme.

spectrumnews.org Traduction de "Largest autism genetics analysis to date uncovers more high-confidence candidates"

La plus grande analyse génétique de l'autisme réalisée à ce jour met en évidence un plus grand nombre de candidats à haut niveau de confiance 
par Laura Dattaro / 6 mai 2021

Capture d'écran d'ordinateur montrant des bandes de couleur résultant de l'ADN séquencé. © Patrick Landmann / Photothèque scientifique Capture d'écran d'ordinateur montrant des bandes de couleur résultant de l'ADN séquencé. © Patrick Landmann / Photothèque scientifique
Après avoir doublé la taille de son échantillon, la plus grande étude de données génétiques de personnes autistes a identifié 255 gènes associés à la condition, soit une augmentation de plus de 40 gènes depuis la mise à jour de 2019 des chercheurs ; 71 des gènes dépassent une barre statistique stricte que l'équipe n'avait pas utilisée auparavant. La nouvelle analyse ajoute également des données provenant de personnes atteintes de retard de développement ou de schizophrénie et prend en compte plusieurs types de mutations.

"Il s'agit d'une avancée très importante dans notre travail", a déclaré Kyle Satterstrom, biologiste informaticien dans le laboratoire de Mark Daly au Broad Institute de Cambridge, dans le Massachusetts. Satterstrom a présenté les résultats de manière virtuelle mardi lors de la réunion annuelle 2021 de l'International Society for Autism Research. (...).

Les analyses précédentes de l'équipe ont utilisé les données de l'Autism Sequencing Consortium, qui inscrit les familles par l'intermédiaire de leurs médecins. Les chercheurs ont principalement parcouru les données génétiques pour trouver des mutations rares, non héritées, liées à l'autisme.

Dans la nouvelle analyse, les chercheurs ont ajouté les données de SPARK - une initiative qui recueille des informations génétiques auprès des personnes autistes et de leurs familles - afin de doubler le nombre de personnes autistes dans l'étude. (SPARK est financée par la Fondation Simons, l'organisation mère de Spectrum). En plus de ces variantes, l'équipe a recherché des variantes héréditaires et des variantes du nombre de copies - des tronçons d'ADN répétés ou manquants, qui ont tendance à se produire spontanément.

"Il s'agit d'un modèle beaucoup plus étoffé que celui que nous avions utilisé auparavant", a déclaré M. Satterstrom dans sa présentation.

Fusionner les ensembles de données 

Les chercheurs ont analysé les parties du génome codant pour les protéines, appelées exome, de 61 877 personnes, dont 20 168 autistes et 5 391 de leurs frères et sœurs non autistes. Cette analyse a permis d'identifier 255 gènes associés à l'autisme.

L'équipe a ensuite ajouté les données d'environ 31 000 enfants présentant un retard de développement, issues du projet Deciphering Developmental Disorders au Royaume-Uni, qui avait précédemment identifié 285 gènes liés au retard de développement. L'analyse des ensembles de données combinés a permis d'identifier 374 gènes associés à un trouble du développement neurologique.

Parmi ceux-ci, 55 n'étaient pas présents sur la nouvelle liste de 255 gènes de l'équipe ou sur la liste des gènes du retard de développement, ce qui suggère une association avec un résultat neurologique plus général, a déclaré Satterstrom.

Il y avait moins de chevauchement avec la méta-analyse de l'exome de la schizophrénie, qui avait identifié 10 gènes fortement associés à la schizophrénie. Dans au moins l'un de ces 10 gènes, un gène TRIO lié à l'autisme, un type de mutation est apparu dans la schizophrénie et un autre dans l'autisme et le retard de développement, ce qui suggère un chevauchement plus important entre les deux dernières conditions. Mais la question de savoir si cette découverte se reproduira avec d'autres gènes reste ouverte, a déclaré Satterstrom.

L'équipe prévoit ensuite d'ajouter 3 000 nouveaux groupes familiaux issus de l'étude SPARK et d'évaluer s'il existe des différences génétiques entre les participants à cette étude, qui permet aux familles de s'inscrire elles-mêmes, et les participants à l'Autism Sequencing Consortium. Étant donné que les méthodes d'inscription diffèrent, les caractéristiques des personnes dans les deux ensembles de données pourraient également différer, a déclaré Satterstrom.

Les études futures pourraient explorer les mécanismes par lesquels les gènes contribuent à l'autisme, ce qui pourrait conduire à de nouvelles interventions, selon Satterstrom. Les gènes pourraient également être utiles aux personnes ou aux familles à la recherche d'un diagnostic génétique.

"Il s'agit essentiellement des premières étapes pour essayer de comprendre comment on pourrait cibler une thérapie pour l'autisme", dit-il

Lisez d'autres comptes rendus de la réunion annuelle de la Société internationale pour la recherche sur l'autisme de 2021.

Traductions

Le Club est l'espace de libre expression des abonnés de Mediapart. Ses contenus n'engagent pas la rédaction.