Il n'y a pas de gènes spécifiques à l'autisme, seulement des gènes du cerveau

Les gènes présents dans l'autisme concernent également d'autres troubles, notamment du neurodéveloppement. Il est prématuré de lier des gènes à l'autisme seulement, et de limiter l'étude à eux.

spectrumnews.org Traduction de "There are no autism-specific genes, just brain genes" par David Ledbetter, Scott Myers / 23 mars 2021

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Expert : David Ledbetter, chef des services cliniques, Dascena

Expert : Scott Myers, professeur associé, Institut de médecine de l'autisme et du développement à Geisinger.

Il est bien établi que des variantes génétiques rares et dommageables ayant des effets importants contribuent à l'autisme. Bien que rares individuellement, ces variantes sont collectivement communes : les tests génétiques cliniques les identifient chez au moins 25 % des personnes autistes. Des études sur ces variantes ont permis d'identifier plus de 100 gènes - et ce n'est pas fini - dans l'autisme.

L'identification de ces gènes est importante, non seulement pour les soins cliniques, mais aussi pour faire progresser notre compréhension des circuits et processus neuronaux impliqués dans l'autisme ou dans ses caractéristiques principales. Elle offre la possibilité de développer des thérapies ciblées sur des diagnostics moléculaires spécifiques. Et à mesure que nous en apprenons davantage sur ces gènes et sur les conséquences des variantes qui perturbent leur fonction, nous avons la possibilité de mieux comprendre les mécanismes qui sous-tendent les cas d'autisme pour lesquels un diagnostic génétique définitif ne peut pas encore être posé.

Mais les découvertes génétiques chez les personnes autistes ne sont pas uniques ; des variantes délétères des mêmes gènes sont également impliquées dans d'autres troubles du développement neurologique, tels que la déficience intellectuelle, l'épilepsie, le trouble déficitaire de l'attention avec hyperactivité et la schizophrénie. Les gènes et les variantes spécifiques ne correspondent pas exactement aux diagnostics cliniques catégoriques ou aux traits cognitifs et comportementaux fondamentaux qui les définissent. En fait, il n'existe pas encore d'exemple unique de gène qui, lorsqu'il est muté, augmente la probabilité d'autisme mais pas celle d'autres troubles du développement neurologique.

Plusieurs études récentes ont cherché à identifier les gènes qui sont plus fortement associés à l'autisme qu'à d'autres troubles du développement neurologique. Le désir d'identifier des gènes relativement spécifiques à l'autisme est compréhensible. Ces informations pourraient améliorer la précision de nos prédictions cliniques et de nos conseils. Et du point de vue de la recherche, l'identification de gènes relativement spécifiques de l'autisme pourrait contribuer à révéler les mécanismes neuronaux des aspects clés de la communication sociale et des difficultés d'interaction, des comportements restreints et répétitifs, et des réponses et intérêts sensoriels atypiques.

Cependant, les données actuelles ne permettent pas d'établir une spécificité significative d'un quelconque gène pour l'autisme. De même, il n'existe pas de voies moléculaires ou de voies ou réseaux neuronaux connus pour être associés de manière unique à l'autisme lorsqu'ils sont perturbés.

Nous recommandons aux chercheurs et aux cliniciens d'éviter de désigner les gènes comme des " gènes de l'autisme ". D'après les données actuelles, ce concept n'a pas de sens. Et le fait de continuer à séparer les gènes liés à des troubles du développement neurologique en catégories basées sur des diagnostics cliniques individuels, même si les gènes et les diagnostics se chevauchent considérablement, risque d'induire en erreur tant dans les soins cliniques que dans la recherche.

À la recherche de la spécificité

Deux études récentes ont examiné la spécificité relative des gènes liés à l'autisme en comparant quels gènes sont mutés - et à quelle fréquence - dans deux groupes différents de personnes : celles qui ont participé à des études sur l'autisme et celles qui ont participé à des études sur la déficience intellectuelle (bien que certaines personnes dans chaque groupe aient les deux conditions). Une étude a montré que les deux groupes présentaient des différences significatives sur ces mesures, laissant entrevoir la possibilité de gènes significativement spécifiques à l'autisme, et l'autre non. Cette approche, bien que pratique en termes de disponibilité des données, est limitée en raison des différences probables dans la distribution du quotient intellectuel entre les groupes et du biais potentiel introduit par l'inégalité des chances pour chaque participant de recevoir chaque diagnostic.

Déclarer prématurément que les mutations dans certains gènes sont spécifiques à l'autisme est problématique pour plusieurs raisons. L'une des implications est que cette information pourrait être incorporée de manière inappropriée dans la prise de décision clinique, y compris dans des panels ou des listes de gènes spécifiques à l'autisme. Certaines autorités ont préconisé de telles listes de gènes, et des panels de séquençage de gènes spécifiques de l'autisme ont été commercialisés par des laboratoires cliniques. Cependant, sur la base des preuves actuelles, il est trompeur de promouvoir ces panels de gènes comme étant significativement distincts des panels de gènes pour la déficience intellectuelle, ou d'omettre les gènes établis liés à la déficience intellectuelle dans l'évaluation des personnes autistes. Le séquençage de tous les gènes d'une personne est supérieur aux panels de gènes en tant que test clinique de premier niveau pour les personnes autistes ou présentant une déficience intellectuelle.

Il serait également prématuré de limiter les études de recherche en neurobiologie de l'autisme à un sous-ensemble de gènes et de circuits sur la base des données des cohortes de convenance qui ont été utilisées pour déterminer la spécificité relative des gènes pour l'autisme. Les progrès dans la compréhension des mécanismes sous-jacents à l'autisme proviendront très probablement d'études de grande envergure portant sur un groupe plus large d'affections résultant d'un dysfonctionnement du cerveau au cours du développement et s'efforçant d'établir un phénotype uniforme pour tous les participants, y compris la mesure de traits et de biomarqueurs cognitifs, moteurs et comportementaux pertinents et distribués en continu.

Il est possible que les études futures identifient des gènes pour lesquels les variantes rares à grand effet sont significativement spécifiques de l'autisme. Ou bien, peut-être, la démonstration de la spécificité au niveau des gènes devra-t-elle attendre des études beaucoup plus vastes ayant la puissance nécessaire pour évaluer les variantes rares qui ont des effets plus modestes. Il est également possible que les traits spécifiques de l'autisme soient davantage déterminés par le "risque polygénique de fond" d'un individu, qui est en grande partie hérité et conféré par l'impact collectif d'un grand nombre de variantes communes dont l'effet individuel est faible, ou par d'autres sources de variation génétiques et non génétiques.

Quoi qu'il en soit, dans l'état actuel des connaissances, il est trop tôt pour considérer que certains gènes sont significativement spécifiques de l'autisme ou pour limiter les tests de diagnostic clinique à un panel particulier de gènes. De même, les chercheurs doivent se garder de limiter les cohortes pour les études physiopathologiques en se fondant sur la spécificité présumée de l'autisme au niveau des gènes.

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David Ledbetter est chef du service clinique de Dascena à Oakland, en Californie.

Scott Myers est professeur associé de pédiatrie à l'Autism & Developmental Medicine Institute de Geisinger à Lewisburg, en

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Pennsylvanie.


PS : 30 mars 2021  sur le blog de Y. Ben-Ari
Il n’y a pas de gène-spécifique de l’autisme, juste des gènes du cerveau !

https://leblogdebenari.com/2021/03/30/gene-autisme/

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