spectrumnews.org Traduction de "‘Polygenic risk scores’ for autism, explained" par Giorgia Guglielmi - 23 mai 2018
Agrandissement : Illustration 1
Les gènes représentent jusqu'à 85 % de l'héritabilité de l'autisme, mais seulement 10 % environ des personnes autistes ont une cause génétique identifiable pour leur diagnostic - généralement une modification rare d'une seule lettre de leur ADN ou une délétion ou une duplication d'une grande partie du génome. Les facteurs génétiques à l'origine de la plupart des cas d'autisme restent mystérieux.
Des preuves de plus en plus nombreuses suggèrent qu'une fraction importante des racines génétiques de l'autisme se présente sous la forme de variantes génétiques communes - des modifications de l'ADN d'une seule lettre appelées polymorphismes d'un seul nucléotide (SNP) - que l'on trouve dans au moins 1 % de la population générale. Chaque variante ne confère généralement qu'une faible augmentation des chances d'une personne d'être atteinte d'une condition complexe telle que l'autisme. Mais collectivement, les variantes communes peuvent augmenter les probabilités d'être atteint d'une condition complexe comme l'autisme.
Au cours des deux dernières décennies, les technologies de dosage des variantes communes ont permis aux chercheurs d'analyser des millions de SNP afin de déterminer ceux qui sont plus fréquents chez les personnes atteintes d'une condition particulière que chez les témoins. Les scientifiques peuvent ensuite appliquer des méthodes statistiques pour calculer un "score de risque polygénique", c'est-à-dire la somme pondérée de tous les variants communs liés à l'affection.
Que savons-nous des scores de risque polygénique pour l'autisme ?
Une vaste étude basée sur la population, publiée en 2019, a analysé les génomes de plus de 20 000 personnes autistes à la recherche de SNP liés à la condition. En calculant les scores de risque polygénique pour l'autisme, les chercheurs ont constaté que les personnes ayant les scores les plus élevés sont près de trois fois plus susceptibles d'être autistes que celles ayant les scores les plus faibles.
D'autres analyses ont montré des résultats mitigés ou aucune association entre les scores de risque polygénique de l'autisme et un diagnostic d'autisme, des traits d'autisme ou d'autres affections cérébrales, selon une analyse non publiée de 30 études publiées entre 2019 et 2022.
Les scores de risque polygénique peuvent-ils prédire l'autisme ou d'autres troubles du développement neurologique ?
Pas vraiment. Les scores ne fournissent que la probabilité d'être atteint d'une condition donnée, et non un diagnostic. Dans la population générale, où la prévalence de l'autisme se situe entre 1 et 3 %, le fait d'avoir un score de risque polygénique qui triple les chances d'être autiste n'augmente pas substantiellement les chances d'être effectivement concerné par cette condition.
Les scores de risque polygénique peuvent avoir des capacités prédictives plus utiles dans des sous-groupes de personnes, telles que celles qui présentent une mutation liée à l'autisme. Parmi les personnes présentant des délétions dans la région chromosomique 22q11.2, par exemple, des variantes communes influencent les risques de handicap intellectuel et de schizophrénie, comme l'a montré une étude réalisée en 2020. Les personnes présentant un score de risque polygénique élevé pour la schizophrénie étaient 24 % plus susceptibles d'être atteintes de schizophrénie que celles qui présentaient les scores les plus faibles. De même, les participants ayant un score de risque polygénique élevé pour la déficience intellectuelle étaient près de 40 % plus susceptibles d'avoir une déficience intellectuelle que ceux qui avaient les scores les plus faibles.
"Il n'est pas utile d'utiliser les scores de risque polygénique pour prédire l'autisme dans la population générale, à moins - mais cela reste à explorer - que l'on soit capable d'isoler un groupe présentant un risque de base déjà accru", déclare Jacob Vorstman, professeur agrégé de psychiatrie à l'université de Toronto au Canada, qui a dirigé l'étude sur les personnes présentant des délétions du gène 22q11.
Les scores de risque polygénique peuvent-ils aider les scientifiques à comprendre la biologie sous-jacente de l'autisme ?
Peut-être. Des données convergentes suggèrent que des variantes génétiques communes expliquent en partie pourquoi seules certaines personnes porteuses de mutations rares et nocives liées à l'autisme sont autistes. Plusieurs études ont montré que certaines combinaisons de variantes communes augmentent la probabilité d'autisme chez les personnes porteuses de mutations héréditaires rares liées à cette condition. Les enfants autistes porteurs de ces mutations héréditaires présentent des scores de risque polygénique plus élevés que prévu par rapport aux scores de leurs parents non autistes, selon une préimpression publiée l'année dernière sur medRxiv.
La combinaison des scores de risque polygénique avec des analyses comportementales et la neuro-imagerie pourrait aider les chercheurs à comprendre comment les gènes influencent le comportement et les fonctions cérébrales. Une étude réalisée en 2021 sur l'ADN et l'activité cérébrale de 81 bébés ayant un frère ou une sœur autiste plus âgé(e) a révélé que les enfants présentant des scores de risque polygénique d'autisme plus élevés avaient des réponses cérébrales modifiées aux informations sociales, par rapport à ceux dont les scores étaient moins élevés.
Que faut-il changer pour que les scores de risque polygénique d'autisme soient utilisés en clinique ?
Jusqu'à présent, les scientifiques se sont surtout appuyés sur les informations génétiques de personnes d'ascendance européenne pour calculer les scores, et les résultats de ces études ne s'appliquent pas aux personnes d'autres origines génétiques. Des efforts visant à diversifier les études génétiques et à augmenter la taille des échantillons pourraient accroître la précision prédictive des scores.
Comment les informations fournies par ces scores peuvent-elles aider les enfants à risque ?
Les informations fournies par les scores de risque polygénique pourraient un jour aider les médecins à poser des diagnostics précis et permettre aux parents de repérer les signes d'autisme chez leur enfant dès son plus jeune âge. Elles pourraient également aider les cliniciens et les parents à éviter les retards dans l'accès de l'enfant aux interventions comportementales précoces, dont il a été démontré qu'elles pouvaient atténuer certaines difficultés liées à l'autisme.
Citer cet article : https://doi.org/10.53053/DWVI9883