spectrumnews.org Traduction de "Two studies highlight role of 'mosaic' mutations in autism" par Charles Q. Choi / 11 janvier 2021
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Les mutations observées dans certaines cellules du corps seulement affectent souvent l'activité des gènes dans le cerveau des personnes autistes et peuvent impliquer de larges segments d'ADN, selon deux nouvelles études publiées aujourd'hui dans "Nature Neuroscience".
Ces mutations en "mosaïque" dans le cerveau et le corps pourraient contribuer de manière importante à l'autisme, suggèrent les chercheurs. Contrairement aux mutations héréditaires, qui sont présentes dans toutes les cellules d'une personne, les mutations en mosaïque apparaissent spontanément après la conception et ne se retrouvent que dans une fraction des cellules du corps.
Dans l'une des nouvelles études, les scientifiques ont analysé l'ensemble des génomes du tissu cérébral de 59 personnes autistes et de 15 personnes non autistes. Ils ont plus particulièrement examiné des échantillons de tissus du cortex préfrontal, une région impliquée dans l'autisme, et se sont concentrés sur les mutations survenues après la conception.
Les chercheurs ont détecté une moyenne de 26 mutations en mosaïque par cerveau, avec des taux de mutation similaires dans les échantillons provenant de personnes autistes et non autistes. Mais les cerveaux des personnes autistes étaient près de 12 fois plus susceptibles de présenter des mutations en mosaïque dans les amplificateurs - des segments d'ADN qui stimulent l'activité des gènes - que les cerveaux des personnes non autistes, ont constaté les chercheurs. Il s'agit de la plus grande collection de données de séquençage du génome entier provenant de cerveaux d'autistes jamais réunie, selon les scientifiques.
Ces résultats suggèrent que les mutations en mosaïque des stimulateurs actifs dans le cerveau pourraient augmenter la probabilité d'être autiste, selon le chercheur de l'étude, Yanmei Dou, chargé de recherche en informatique biomédicale à l'université de Harvard. L'analyse des régions affectées par les amplificateurs pourrait aider à révéler de nouveaux gènes liés à l'autisme, dit-elle.
Nombre de copies
Dans l'autre nouvelle étude, les chercheurs se sont concentrés sur les variations du nombre de copies en mosaïque (CNV), qui sont des duplications ou des suppressions de segments d'ADN. Ils se sont appuyés sur des données génétiques provenant de deux dépôts : la Simons Simplex Collection et le projet SPARK (Simons Powering Autism Research for Knowledge). (Ces deux initiatives sont financées par la Fondation Simons, l'organisation mère de Spectrum).
Les scientifiques ont analysé les données de 12 077 personnes autistes et de 5 500 frères et sœurs non autistes. Ils ont constaté que les personnes autistes sont plus de 11 fois plus susceptibles de posséder des CNV en grande mosaïque que leurs frères et sœurs non autistes. En outre, plus la CNV est grande, plus les traits autistiques d'une personne semblent être prononcés.
Plus la mosaïque de CNV est grande, plus elle est susceptible de perturber des gènes importants pour le développement neurologique et donc d'augmenter la probabilité d'autisme, selon les chercheurs.
Des recherches antérieures ont montré que les CNV héréditaires représentent environ 5 % des cas d'autisme. Les nouveaux travaux estiment que les CVN en grande mosaïque représentent environ 0,2 % des cas d'autisme. En outre, alors que les CNV héréditaires affectent généralement le même petit ensemble de sites dans les génomes d'individus non apparentés, la nouvelle étude a révélé que les CNV en grande mosaïque sont au contraire très dispersés, ce qui suggère qu'ils contribuent à l'autisme par différents mécanismes.
"Nos conclusions ouvrent la voie à d'autres formes de dépistage clinique génétique permettant d'identifier les personnes à risque de troubles du spectre autistique dès leur plus jeune âge", déclare le chercheur Maxwell Sherman, étudiant diplômé du Massachusetts Institute of Technology.
"Nos travaux ne montrent pas qu'un porteur d'une grande mosaïque de CNV sera autiste", déclare Sherman. "En effet, nous avons observé quelques exemples de frères et sœurs apparemment non affectés qui étaient porteurs de CNV en grande mosaïque, bien que beaucoup moins que les porteurs autistes".
Sherman et ses collègues prévoient d'étudier si des facteurs environnementaux ou des variations génétiques héréditaires augmentent le risque de CNV en mosaïque.