Jair Renan Bolsonaro, né en 1998, fils benjamin du président de la République et de Ana Cristina Siqueira Valle, fait l'objet d'une enquête de la police fédérale (PF), ouverte le 15 mars 2021, pour trafic d'influence présumé par le biais de sa société Bolsonaro Jr Eventos e Mídia, qu'il a créée en novembre 2020, avec un capital social de 105.000 reais (14.200 €, en 2021).
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Carlos Bolsonaro, né le 7 décembre 1982, est quant à lui fils du président et de Rogéria Nantes Nunes Braga et a gagné dans sa famille le surnom de " pit bull ". Il fait l'objet depuis septembre 2019 de deux enquêtes du ministère public de Rio (MP-RJ), qui le soupçonne d'avoir eu des employés fantômes dans son cabinet lors de son premier mandat (débuté en 2001) à la mairie de Rio de Janeiro. Plusieurs de ces employés ont ensuite également travaillé, avec les mêmes suspicions de la justice envers eux, dans le cabinet de son frère, l'alors député de l'Etat de Rio de Janeiro, Flavio Bolsonaro.
Carlos Bolsonaro a également été interrogé par la police fédérale (PF), en 2020, dans le cadre de l'enquête sur les actes antidémocratiques, envers la Cour suprême (STF), une enquête qui vise à identifier les responsables d'attaques et d'offenses, dont des assistants du conseiller municipal, à cette Cour.
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Eduardo Bolsonaro, qui est né en 1984, est au centre d'une enquête préliminaire du procureur-général du Brésil (PGR) sur des paiements en espèces lors de l'acquisition de deux appartements dans les beaux quartiers de Rio de Janeiro entre 2011 et 2016.
Comme son frère Carlos, il a également été cité et interrogé dans le cadre de l'enquête sur les actes antidémocratiques contre le STF.
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Fils aîné du président de la République, Flávio (1981) est accusé d'avoir dirigé un système de fraude multimillionnaire (" rachadinha ") et de détournement de fonds publics - en l'occurence des salaires, des frais et des primes - dans son ancien cabinet de député à l'Assemblée législative de Rio de Janeiro (Alerj), réalisé via la complicité de douze employés fantômes, souvent proches de parents ou nommés via des connaissances, entre 2007 et 2018. Flavio Bolsonaro a été dénoncé, en novembre 2020, par le ministère public de l'Etat de Rio de Janeiro (MP-RJ), pour avoir pratiqué de la corruption passive, du blanchiment d'argent et d'appartenir à une organisation criminelle.
L'un de ses principaux conseillers, l'ancien policier militaire Fabrício Queiroz, actuellement écroué en prison domiciliaire, soupconné d'être un milicien, a été désigné par les enquêteurs comme l'opérateur de ce système tentaculaire de fraude.
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L'une des ex-épouses de Bolsonaro, Ana Cristina Siqueira Valle (1998/2008), a été citée dans l'enquête sur les employés fantômes à l'Alerj. Elle avait huit parents employés dans le cabinet de Carlos Bolsonaro au conseil municipal de Rio de Janeiro. Les données financières ont montré qu'ils débitaient, en cash, en moyenne, 84% de leurs salaires.
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Le nom de l'actuelle épouse de Jair Bolsonaro, Michelle Bolsonaro, est aussi apparu lors du dévoilement en 2020 des comptes bancaires et relevés fiscaux de Fabrício Queiroz, proche parmi les proches du président de la République et cela depuis 1984. Les enquêtes ont montré que Queiroz a crédité 72.000 R$ (11.000 €, en 2021) sur le compte bancaire de Michelle Bolsonaro entre 2011 et 2018. L'épouse de Queiroz, Márcia Oliveira de Aguiar, aussi déposé sur le même compte bancaire 17.000 R$ (3.000 €, en 2021).